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Course Outline
Fiji와 ImageJ 소개
- Fiji와 과학 연구에서의 응용 개요
- ImageJ의 아키텍처와 플러그인 이해
- 최적의 성능을 위해 Fiji 설치 및 설정
기본 이미지 처리 기술
- 이미지 획득 및 임포트 형식
- 대비, 밝기 조정 및 필터 적용
- 이미지 스택 및 투영 방법
고급 Image Analysis
- 세분화 기술: 임계값 처리 및 엣지 검출
- 조직학적 샘플의 객체 세기와 입자 분석
- 영역, 둘레 및 기타 형태학적 특징 측정
Bio학적인 샘플 작업
- 조직 세포, 혈액 세포, 조류 등의 이미지 처리
- 염색 조직의 색상 분할 및 분석
- 타임랩스 분석 및 세포 이동 추적
자동화 및 맞춤화
- 반복 작업에 대한 매크로 작성 및 실행
- Fiji 플러그인을 사용한 전문 분석
- ImageJ Macro Language (IJM)로 기본 스크립팅
Data Management 및 보고서 작성
- 결과 내보내기 및 보고서 작성
- 이미지 주석 작성 및 출판을 위한 데이터 준비
- 재현 가능한 이미지 분석을 위한 최선책
요약 및 다음 단계
Requirements
- 생물학적 이미징 개념에 대한 기본 이해
- 현미경 및 조직학적 기술에 대한 familiarity
- 기본 컴퓨터 활용 능력
대상
- 바이오테크놀로지와 환경 독성학 연구자
- 조직학적 및 세포 이미징을 다루는 실험실 기술자
- 정량적 이미지 분석에 관심이 있는 과학자
14 Hours