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기간 14 시간
코스 개요
피지(Fiji)와 ImageJ 입문
- 피지(Fiji) 개요 및 과학 연구에서의 활용
- ImageJ의 아키텍처 및 플러그인 이해
- 최적의 성능을 위한 피지(Fiji) 설치 및 설정
기본 이미지 처리 기법
- 이미지 취득 및 가져오기(Import) 형식
- 대비(Contrast), 밝기(Brightness) 조절 및 필터 적용
- 이미지 스택킹(Stacking) 및 투영(Projection) 방법
고급 이미지 분석
- 분할(Segmentation) 기법: 임계값 처리(Thresholding) 및 가장자리 감지
- 히스톨로지 샘플에서의 객체 카운팅 및 입자 분석
- 면적, 둘레 및 기타 형태학적 특성 측정
생물학적 샘플 작업
- 히스톨로지 조직, 혈구, 미세조류 이미지 처리
- 색상 분해(Color Deconvolution) 및 염색 조직 분석
- 타임랩스(Time-lapse) 분석 및 세포 이동 추적
자동화 및 커스터마이징
- 반복 작업을 위한 매크로 생성 및 실행
- 전문적 분석을 위한 피지(Fiji) 플러그인 사용
- ImageJ 매크로 언어(IJM)를 활용한 기본 스크립팅
데이터 관리 및 보고
- 결과 내보내기(Export) 및 보고서 생성
- 이미지 주석 달기 및 발표용 데이터 준비
- 재현 가능한 이미지 분석을 위한 모범 사례
요건
- 생물학적 이미징 개념에 대한 기본 이해
- 현미경 및 히스톨로지 기법 관련 지식 보유
- 기본적인 컴퓨터 리터러시 능력
대상 독자
- 생명공학 및 환경 독성학 분야 연구자
- 히스톨로지 및 세포 이미징을 다루는 실험실 테크니션
- 정량적 이미지 분석에 관심이 있는 과학자